现有肿瘤流行病学研究室和癌基因与相关基因国家重点实验室，以及肿瘤功能基因研究组、肿瘤转移研究组、肿瘤表观遗传学研究组、肿瘤分子病理研究组、肿瘤生物治疗研究组、干细胞微环境研究组、肿瘤免疫调节研究组、肿瘤分子诊断研究组、肿瘤干细胞研究组、肿瘤靶向治疗研究组、肿瘤基因组不稳定性研究组和实验病理研究组等十三个课题组。
    研究所的方向和任务主要是恶性肿瘤的流行病学与病因学研究，肿瘤发病机理的探索以及发展基因诊断和基因治疗、细胞及免疫学诊断和治疗等生物高科技基础及应用研究，探索肿瘤防治的新途径。癌基因与相关基因国家重点实验室的主攻方向是研究与确定与癌发生发 展相关的癌基因、抑癌基因及其它调控细胞生长的基因群， 同时利用系统生物学理论来研究在癌发生发展的分子机理及诊断、防治癌的新途径。各研究室拥有一批先进的科学仪器设备，具有较好的研究实验条件。先后与一些市级综合性医疗单位、细胞研究所等建立了科研合作关系。
    “八五”以来，我所先后承担的国家项目有：“八六三”高新技术、国家重点基础研究973）项目、国家攻关项目、国家自然科学基金重大项目等。此外，我所还与国内外著名的大学、研究所联合申请课题，进行了多项国际合作研究。
    研究所与国内外交往非常密切，历年来已与10多个国家和地区的科技人员进行了学术交流，还聘请了多位国外著名专家任研究室顾问。所内研究人员也经常应邀前往世界许多国家和地区参加国际性学术会议、考察访问和合作研究等